Hugging Face's logo

Datasets:
IT-ZBMED
/
Agriculture_NER_Dataset_for_FAIR_Metadata_Enrichment

Tasks:
Token Classification
Languages:
English
German
Size:
1K<n<10K
Tags:
agriculture
Named_entity_recognition
NER
LLM
Crops
soil
License:
Dataset card Files
xet
Community
1
Dataset Viewer
Auto-converted to Parquet Duplicate
file_name
stringclasses
318 values
Tokens
listlengths
1
294
ner_tags
listlengths
1
294
Labels
listlengths
1
294
number_of_tokens
int64
1
294
Language
stringclasses
19 values
source
stringclasses
2 values
Label_counts
stringclasses
194 values
number_of_annotations
int64
0
14
doi
stringclasses
251 values
sentence_id
stringlengths
7
39
98412.txt
[ "Title", ":", "\n", "2020_Helfrich_AGEE", "\n\n", "Abstract", ":", "\n", "Datenmeldung", "nach", "dem", "EGovG." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
12
de
OpenAgrar
Counter()
0
null
98412-0
98412.txt
[ "Der", "Datensatz", "kann", "auf", "Anfrage", "zur", "Verfügung", "gestellt", "werden", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
10
de
OpenAgrar
Counter()
0
null
98412-1
98412.txt
[ "Eine", "Datennutzungsvereinbarung", "wird", "abgeschlossen", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O" ]
5
de
OpenAgrar
Counter()
0
null
98412-2
98412.txt
[ "Grassland", "conversion", "to", "cropland", "bears", "a", "risk", "of", "increased", "nitrate", "(", "NO3−", ")", "leaching", "and", "nitrous", "oxide", "(", "N2O", ")", "emission", "due", "to", "enhanced", "nitrogen", "(", "N", ")", "mineralization", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
30
en
OpenAgrar
Counter()
0
null
98412-3
98412.txt
[ "This", "study", "investigates", "the", "dynamics", "of", "mineral", "N", "and", "N2O", "emissions", "following", "chemical", "and", "mechanical", "conversion", "from", "permanent", "grassland", "to", "cropland", "(", "maize", ")", "at", "two", "sites", "with", "different", "texture", "(", "clayey", "loam", "and", "sandy", "loam", ")", "and", "fertilization", "regime", "(", "with", "and", "without", "mineral", "N", "-", "fertilization", ")", "over", "a", "two", "-", "year", "period", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 15, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 14, 14, 14, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cropSpecies", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilTexture", "I-soilTexture", "O", "B-soilTexture", "I-soilTexture", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-duration", "I-duration", "I-duration", "I-duration", "O" ]
56
en
OpenAgrar
Counter({'soilTexture': 2, 'cropSpecies': 1, 'duration': 1})
4
null
98412-4
98412.txt
[ "Soil", "mineral", "N", "levels", "increased", "shortly", "after", "conversion", "and", "remained", "elevated", "in", "converted", "plots", "compared", "to", "permanent", "grassland", "or", "long", "-", "term", "cropland", "in", "the", "second", "year", "of", "investigation", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
30
en
OpenAgrar
Counter()
0
null
98412-5
98412.txt
[ "Fluxes", "of", "N2O", "were", "higher", "from", "converted", "plots", "than", "permanent", "grassland", "or", "cropland", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
14
en
OpenAgrar
Counter()
0
null
98412-6
98412.txt
[ "However", ",", "soil", "mineral", "N", "contents", "and", "cumulative", "N2O", "emissions", "did", "not", "differ", "between", "conversion", "types", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
17
en
OpenAgrar
Counter()
0
null
98412-7
98412.txt
[ "Only", "the", "distribution", "of", "N2O", "losses", "over", "the", "two", "years", "differed", ":", "while", "losses", "were", "of", "similar", "magnitude", "in", "both", "years", "in", "mechanically", "converted", "plots", ",", "the", "major", "part", "of", "N2O", "loss", "in", "chemically", "converted", "plots", "occurred", "in", "the", "first", "year", "after", "conversion", "while", "emissions", "approximated", "grassland", "level", "in", "the", "second", "year", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
53
en
OpenAgrar
Counter()
0
null
98412-8
98412.txt
[ "N2O", "fluxes", "were", "mainly", "controlled", "by", "water", "-", "filled", "pore", "space", "and", "soil", "NO3−", "levels", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
16
en
OpenAgrar
Counter()
0
null
98412-9
98412.txt
[ "Despite", "differences", "in", "N", "levels", "at", "the", "two", "sites", ",", "these", "key", "findings", "are", "similar", "on", "both", "study", "sites", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
20
en
OpenAgrar
Counter()
0
null
98412-10
98412.txt
[ "They", "indicate", "strongly", "accelerated", "mineralization", "after", "conversion", ",", "an", "effect", "that", "still", "lasted", "in", "the", "converted", "plots", "at", "the", "end", "of", "the", "two", "-", "year", "investigation", "irrespective", "of", "the", "conversion", "type", "used", ".", "\n\n" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
34
en
OpenAgrar
Counter()
0
null
98412-11
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "Title", ":", "\n ", "pH", "-", "dependency", "of", "P", "adsorption", "kinetics", "on", "goethite", "\n", "Abstract_text_1", ":", "\n ", "pH", "-", "dependency", "of", "P", "adsorption", "kinetics", "on", "goethite", ".", "\n" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
27
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-0
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "Abstract_text_2", ":", "\n ", "P", "adsorption", "was", "investigated", "on", "synthetic", "and", "commercially", "available", "goethite", "(", "99", "%", ",", "Alfa", "Aesar", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
21
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-1
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "The", "composition", "and", "crystallinity", "was", "confirmed", "by", "X", "-", "ray", "diffraction", "analyses", "with", "an", "Empyrean", "powder", "diffractometer", "(", "PANalytical", ")", "with", "Cu", "Kα", "radiation", "(", "λ=0.15418", "nm", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
29
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-2
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "The", "determination", "of", "the", "d", "-", "values", "and", "the", "verification", "of", "the", "calculated", "lattice", "parameter", "were", "performed", "using", "the", "XPowder", "software", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
22
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-3
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "The", "specific", "surface", "area", "of", "17.2", "m2", "g-1", "was", "determined", "with", "an", "Autosorb-1", "(", "Quantachrome", ")", "using", "a", "five", "-", "point", "BET", "measurement", "and", "N2", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
26
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-4
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "The", "point", "of", "zero", "charge", "(", "PZC", ")", "was", "determined", "using", "potentiometric", "titration", "by", "weighing", "0.5", "g", "of", "goethite", "into", "50", "ml", "PE", "-", "tubes", "and", "adding", "of", "10", "ml", "of", "a", "0.02", "M", ",", "0.2", "M", ",", "and", "2", "M", "KCl", "solution", ",", "respectively", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
46
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-5
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "The", "KCl", "solutions", "were", "diluted", "with", "ultrapure", "water", "to", "a", "total", "volume", "of", "20", "ml", ",", "leading", "to", "final", "concentrations", "of", "0.01", "M", ",", "0.1", "M", ",", "and", "1", "M", ",", "respectively", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
33
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-6
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "After", "closing", "the", "tubes", ",", "the", "samples", "were", "equilibrated", "for", "4", "days", "at", "25", "°", "C", "to", "reach", "an", "equilibration", "pH", "value", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 14, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-duration", "I-duration", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
23
en
BonaRes
Counter({'duration': 1})
1
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-7
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "Following", ",", "the", "suspension", "was", "titrated", "with", "0.1", "M", "KOH", ",", "and", "the", "pH", "was", "recorded", "after", "each", "addition", "of", "KOH", "as", "a", "function", "of", "the", "volume", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
28
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-8
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "A", "similar", "procedure", "was", "used", "for", "the", "blank", "solutions", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
10
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-9
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "The", "adsorbed", "amounts", "of", "H+", "or", "OH-", "were", "calculated", "from", "the", "amount", "of", "KOH", "added", "to", "the", "samples", "minus", "the", "amount", "of", "KOH", "used", "by", "blank", "titration", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
28
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-10
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "The", "titration", "curves", "of", "the", "three", "different", "concentration", "steps", "intersect", "at", "the", "PZC", ",", "which", "was", "8.8", "for", "pure", "goethite", "without", "adsorbed", "P.", "P" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
24
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-11
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "adsorption", "on", "goethite", "was", "studied", "in", "a", "batch", "setup", "at", "the", "pH", "values", "of", "4", ",", "6", ",", "8", ",", "10", ",", "and", "12", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
25
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-12
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "Therefore", ",", "goethite", "sample", "material", "(", "5", "g", ")", "for", "the", "respective", "pH", "steps", "was", "adjusted", "to", "pH", "4", ",", "6", ",", "8", ",", "10", ",", "or", "12", ",", "respectively", ",", "in", "ultrapure", "water", "with", "0.01", "M", "HCl", "(", "pH", "4", ")", ",", "or", "0.1", "M", "to", "5", "M", "KOH", "(", "pH", "6", "to", "12", ")", "using", "a", "Potentiometric", "Compact", "Titrator", "G20S", "and", "combined", "DGi115", "-", "SC", "pH", "electrode", "(", "Mettler", "-", "Toledeo", ")", "under", "continuous", "stirring", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 31, 31, 0, 31, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 31, 31, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 31, 31, 0, 31, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilPH", "B-soilPH", "O", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilPH", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilPH", "B-soilPH", "O", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
78
en
BonaRes
Counter({'soilPH': 8})
8
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-13
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "For", "P", "adsorption", ",", "0.5", "g", "of", "goethite", "and", "40", "ml", "of", "a", "0.15", "mmol", "l-1", "KH2PO4", ",", "solution", ",", "adjusted", "to", "pH", "4", ",", "6", ",", "8", ",", "10", ",", "or", "12", "as", "well", ",", "were", "mixed", "to", "achieve", "a", "solid", "-", "solution", "ratio", "of", "1:80", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 31, 31, 0, 31, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilPH", "B-soilPH", "O", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
48
en
BonaRes
Counter({'soilPH': 3})
3
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-14
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "The", "goethite-", "KH2PO4", "mixture", "was", "shaken", "horizontally", "at", "150", "motions", "min-1", "for", "24", "h.", "The", "P", "concentration", "in", "the", "solution", "was", "determined", "after", "reaction", "times", "of", "2", ",", "24", ",", "48", ",", "and", "168", "h.", "The", "samples", "have", "been", "centrifuged", "for", "15", "min", "at", "3500", "rpm", "and", "the", "clear", "supernatant", "was", "filtrated", "by", "using", "P", "-", "poor", "Whatmann", "512", "½", "filters", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 14, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-duration", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-duration", "I-duration", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
62
en
BonaRes
Counter({'duration': 2})
2
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-15
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "The", "concentrations", "of", "P", "and", "Fe", "were", "determined", "using", "inductively", "coupled", "plasma", "atomic", "emission", "spectroscopy", "(", "ICP", "-", "AES", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
21
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-16
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "The", "adsorption", "experiments", "were", "done", "in", "duplicate", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
8
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-17
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "Under", "real", "conditions", "in", "the", "soil", ",", "an", "influence", "of", "the", "P", "sorption", "on", "the", "pH", "is", "to", "be", "expected", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
21
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-18
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "Therefore", ",", "the", "pH", "change", "was", "taken", "into", "account", "both", "at", "the", "beginning", "and", "at", "the", "end", "of", "the", "adsorption", "experiments", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
22
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-19
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "The", "pH", "change", "was", "measured", "in", "a", "reference", "experiment", "that", "was", "treated", "exactly", "under", "the", "same", "conditions", "as", "P", "adsorption", "experiment", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
22
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-20
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "The", "amount", "of", "adsorbed", "P", "was", "referred", "to", "both", "the", "initial", "and", "the", "final", "pH.", "Considering", "the", "initial", "pH", ",", "P", "adsorption", "on", "goethite", "was", "highest", "for", "pH", "8", ",", "yielding", "a", "P", "surface", "coverage", "of", "0.75", "µmol", "m-2", "after", "a", "reaction", "time", "of", "168", "h", ",", "followed", "by", "pH", "6", "with", "0.72", "µmol", "m-2", ",", "and", "pH", "4", "with", "0.68", "µmol", "m-2", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 31, 31, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 14, 0, 0, 0, 31, 31, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 31, 31, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilPH", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-duration", "I-duration", "O", "O", "O", "B-soilPH", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilPH", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O" ]
64
en
BonaRes
Counter({'soilPH': 6, 'duration': 1})
7
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-21
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "The", "extent", "of", "adsorption", "decreased", "from", "pH", "8", "to", "10", "with", "0.58", "µmol", "m-2", "and", "was", "lowest", "for", "pH", "12", "with", "0.18", "µmol", "m-2", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 31, 31, 0, 31, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 31, 31, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilPH", "B-soilPH", "O", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilPH", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O" ]
25
en
BonaRes
Counter({'soilPH': 5})
5
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-22
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "The", "solution", "pH", "decreased", "for", "the", "initial", "pH", "4", "to", "3.9", ".", ",", "and", "for", "the", "initial", "pH", "of", "6", ",", "the", "final", "pH", "was", "5.0", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 31, 31, 0, 31, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 31, 0, 31, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilPH", "B-soilPH", "O", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilPH", "O", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
27
en
BonaRes
Counter({'soilPH': 5})
5
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-23
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "For", "initial", "pH", "values", "8.0", "and", "10.0", ",", "the", "corresponding", "final", "pH", "values", "were", "6.7", "and", "7.6", ",", "respectively", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
20
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-24
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "At", "initial", "pH", "12.0", ",", "the", "decrease", "of", "the", "solution", "pH", "weakened", "with", "a", "final", "pH", "of", "11.6", "." ]
[ 0, 0, 31, 31, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 31, 0, 31, 0 ]
[ "O", "O", "B-soilPH", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilPH", "O", "B-soilPH", "O" ]
19
en
BonaRes
Counter({'soilPH': 4})
4
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-25
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b.txt
[ "Research", "domain", ":", "Soil", "Sciences", "Research", "question", ":", "How", "does", "the", "solution", "-", "pH", "affect", "the", "amount", "of", "adsorbed", "phosphorus", "on", "the", "goethite", "surface", "?", "\n", "Keywords", ":", "\n ", "Soil", ",", "phosphorus", ",", "nonmetals", ",", "adsorption", ",", "Soil", ",", "Phosphorus", ",", "Adsorption", ",", "pH", ",", "Goethite", ",", "Hydroxides", ",", "Boden", ",", "Phosphor", ",", "Adsorption", "\n" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
55
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-exb6-a553
142faafb-4e71-4b1e-b550-ca6864f5234b-26
e3d870f9-2aad-470d-bafb-b587cb5e9c58.txt
[ "Title", ":", "\n ", "Lysimeter", "data", "Rostock", ":", "amount", "of", "water", ",", "pH", "and", "element", "concentrations", "of", "freely", "drained", "pore", "water", "(", "2020", ")", "\n", "Abstract_text_1", ":", "\n ", "Lysimeter", "data", "Rostock", ":", "amount", "of", "water", ",", "pH", "and", "element", "concentrations", "of", "freely", "drained", "pore", "water", "(", "2020", ")", ".", "\n", "Abstract_text_2", ":", "\n ", "The", "dataset", "contains", "soil", "pore", "water", "data", "from", "three", "soil", "monolith", "profiles", "from", "along", "a", "hill", "slope", "in", "Northern", "Germany", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 31, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-city", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-startTime", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-city", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-startTime", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
73
en
BonaRes
Counter({'city': 2, 'startTime': 2, 'soilPH': 1})
5
https://doi.org/10.20387/bonares-2191-yv74
e3d870f9-2aad-470d-bafb-b587cb5e9c58-0
e3d870f9-2aad-470d-bafb-b587cb5e9c58.txt
[ "Data", "inform", "about", "the", "amount", "of", "freely", "drained", "water", ",", "pH", "and", "element", "concentrations", "(", "TC", ",", "IC", ",", "OC", ",", "TN", ",", "NH4", "+", "-N", ",", "NO2-", "-N", ",", "NO3-", "-N", ",", "PO43-", "-P", ",", "total", "Ca", ",", "P", ",", "Fe", ",", "Al", ",", "and", "Mn", ")", "in", "filtered", "(", "0.45", "µm", ")", "soil", "pore", "water", "samples", "collected", "at", "15", "points", "in", "time", "over", "409", "hours", "in", "2020", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 31, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-startTime", "O" ]
70
en
BonaRes
Counter({'soilPH': 1, 'startTime': 1})
2
https://doi.org/10.20387/bonares-2191-yv74
e3d870f9-2aad-470d-bafb-b587cb5e9c58-1
e3d870f9-2aad-470d-bafb-b587cb5e9c58.txt
[ "Research", "domain", ":", "Soil", "Sciences", "Research", "question", ":", "Three", "soil", "profiles", "with", "redoximorphic", "features", "were", "selected", "along", "a", "slight", "hill", "slope", "and", "lysimeter", "monoliths", "were", "collected", "by", "drilling", "in", "2018", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-startTime", "O" ]
31
en
BonaRes
Counter({'startTime': 1})
1
https://doi.org/10.20387/bonares-2191-yv74
e3d870f9-2aad-470d-bafb-b587cb5e9c58-2
e3d870f9-2aad-470d-bafb-b587cb5e9c58.txt
[ "Since", "then", "monoliths", "were", "subjected", "to", "rising", "and", "falling", "water", "tables", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
12
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-2191-yv74
e3d870f9-2aad-470d-bafb-b587cb5e9c58-3
e3d870f9-2aad-470d-bafb-b587cb5e9c58.txt
[ "To", "assess", "the", "velocity", "and", "characteristics", "of", "freely", "draining", "pore", "water", "in", "the", "three", "soil", "monoliths", "the", "amount", "of", "freely", "draining", "pore", "water", ",", "pH", "and", "element", "concentrations", "of", "total", "C", ",", "N", ",", "P", ",", "Al", ",", "Fe", ",", "Mn", ",", "and", "Ca", "as", "well", "as", "inorganic", "and", "organic", "C", "(", "DIC", ",", "DOC", ")", ",", "PO43", "-", "-P", ",", "NH4", "+", "-N", ",", "NO2", "-", "-", "and", "NO3", "-", "-N-", "in", "solutions", "(", "0.45", "µm", ")", "were", "determined", ".", "\n" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 31, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilPH", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-soilOrganicCarbon", "I-soilOrganicCarbon", "O", "O", "O", "B-soilOrganicCarbon", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
82
en
BonaRes
Counter({'soilOrganicCarbon': 2, 'soilPH': 1})
3
https://doi.org/10.20387/bonares-2191-yv74
e3d870f9-2aad-470d-bafb-b587cb5e9c58-4
e3d870f9-2aad-470d-bafb-b587cb5e9c58.txt
[ "Keywords", ":", "\n ", "Soil", ",", "opendata", ",", "specific", "UV", "absorbance", "(", "SUVA", ")", ",", "Boden", ",", "Bodenwasser", ",", "Phosphor", ",", "Gelöster", "organischer", "Kohlenstoff", ",", "Kohlenstoff", ",", "Nitrat", ",", "Nitrit", ",", "Aluminium", ",", "Calcium", ",", "Eisen", ",", "pH", "-", "Wert", ",", "Phosphat", ",", "Ammonium", ",", "Stickstoff", "\n" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
46
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-2191-yv74
e3d870f9-2aad-470d-bafb-b587cb5e9c58-5
95393.txt
[ "Title", ":", "\n", "Blei", "in", "Fischen", "aus", "der", "Nord-" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
9
de
OpenAgrar
Counter()
0
10.3220/DATA20240417174443-0
95393-0
95393.txt
[ "und", "Ostsee", "(", "2019", ")", "\n\n" ]
[ 0, 0, 0, 7, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "B-startTime", "O", "O" ]
6
de
OpenAgrar
Counter({'startTime': 1})
1
10.3220/DATA20240417174443-0
95393-1
95393.txt
[ "Abstract", ":", "\n", "Blei", "ist", "ein", "giftiges", "Schwermetall", "und", "weltweit", "verbreitet", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
12
de
OpenAgrar
Counter()
0
10.3220/DATA20240417174443-0
95393-2
95393.txt
[ "Die", "Gehalte", "von", "Blei", "in", "Meeresfisch", "werden", "i", "m", "Rahmen", "des", "Umwelt", "-", "Monitorings", "des", "Thünen", "-", "Instituts", "für", "Fischereiökologie", "regelmäßig", "überwacht", ",", "u.a", ".", "um", "regionale", "und", "zeitliche", "Unterschiede", "in", "der", "Kontamination", "zu", "erfassen", ".", "Die", "Ergebnisse", "fließen", "in", "nationale", "und", "europäische", "Umweltbewertungen", "ein", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
46
de
OpenAgrar
Counter()
0
10.3220/DATA20240417174443-0
95393-3
95393.txt
[ "Die", "Daten", "sind", "Teil", "des", "Monitorings", "i", "m", "Thünen", "-", "Institut", "für", "Fischereiökologie", "und", "sind", "als", "solche", "über", "die", "ICES", "-", "Datenbank", "Dome", "öffentlich", "zugänglich", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
26
de
OpenAgrar
Counter()
0
10.3220/DATA20240417174443-0
95393-4
95393.txt
[ "Erläuterungen", "zu", "den", "ICES", "Codes", "in", "der", "angehängten", "Datei", "findet", "man", "hier", ":", "https://www.ices.dk/data/vocabularies/Pages/default.aspx", "\n\n" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
15
de
OpenAgrar
Counter()
0
10.3220/DATA20240417174443-0
95393-5
96125.txt
[ "Title", ":", "\n", "PAH", "-", "Metaboliten", "in", "Fischen", "aus", "der", "Nord-" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-city", "O", "O", "O" ]
11
de
OpenAgrar
Counter({'city': 1})
1
10.3220/DATA20240515104607-0
96125-0
96125.txt
[ "und", "Ostsee", "(", "2018", ")", "\n\n", "Abstract", ":", "\n", "Polyaromatische", "Kohlenwasserstoffe", "(", "PAH", ")", "sind", "Bestandteil", "fossiler", "Energieträger", "und", "haben", "natürliche", "und", "anthropogene", "Quellen", "." ]
[ 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0 ]
[ "O", "O", "O", "B-startTime", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-city", "O" ]
25
de
OpenAgrar
Counter({'startTime': 1, 'city': 1})
2
10.3220/DATA20240515104607-0
96125-1
96125.txt
[ "Man", "findet", "sie", "in", "der", "Umwelt", "zum", "Beispiel", "in", "der", "Nähe", "von", "Häfen", "oder", "Schifffahrtsrouten", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
16
de
OpenAgrar
Counter()
0
10.3220/DATA20240515104607-0
96125-2
96125.txt
[ "Zur", "Gruppe", "der", "PAH", "gehören", "auch", "krebserregende", "Substanzen", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
9
de
OpenAgrar
Counter()
0
10.3220/DATA20240515104607-0
96125-3
96125.txt
[ "Fische", "metabolisieren", "PAH", "sehr", "schnell", ",", "so", "dass", "PAH", "selbst", "in", "Fischen", "kaum", "nachweisbar", "sind", ",", "wohl", "aber", "ihre", "Metaboliten", "in", "der", "Galle", "des", "Fisches", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-city", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
26
de
OpenAgrar
Counter({'city': 1})
1
10.3220/DATA20240515104607-0
96125-4
96125.txt
[ "Die", "Gehalte", "von", "PAK", "-", "Metaboliten", "in", "Meeresfisch", "werden" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
9
de
OpenAgrar
Counter()
0
10.3220/DATA20240515104607-0
96125-5
96125.txt
[ "i", "m", "Rahmen", "des", "Umwelt", "-", "Monitorings", "des", "Thünen", "-", "Instituts", "für", "Fischereiökologie", "regelmäßig", "überwacht", ",", "um", "die", "Höhe", "der", "PAK", "-", "Belastung", "indirekt", "zu", "erfassen", "und", "zu", "bewerten", "sowie", "regionale", "und", "zeitliche", "Unterschiede", "in", "dieser", "Belastung", "festzustellen", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-city", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
39
de
OpenAgrar
Counter({'city': 1})
1
10.3220/DATA20240515104607-0
96125-6
96125.txt
[ "Die", "Ergebnisse", "fließen", "in", "nationale", "und", "europäische", "Umweltbewertungen", "ein", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
10
de
OpenAgrar
Counter()
0
10.3220/DATA20240515104607-0
96125-7
96125.txt
[ "Die", "Daten", "sind", "Teil", "des", "Monitorings", "i", "m", "Thünen", "-", "Institut", "für", "Fischereiökologie", "und", "sind", "als", "solche", "über", "die", "ICES", "-", "Datenbank", "Dome", "öffentlich", "zugänglich", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
26
de
OpenAgrar
Counter()
0
10.3220/DATA20240515104607-0
96125-8
96125.txt
[ "Erläuterungen", "zu", "den", "ICES", "Codes", "in", "der", "angehängten", "Datei", "findet", "man", "hier", ":", "https://www.ices.dk/data/vocabularies/Pages/default.aspx", "\n\n" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
15
de
OpenAgrar
Counter()
0
10.3220/DATA20240515104607-0
96125-9
97814.txt
[ "Title", ":", "\n", "Dataset", "of", "a", "Germany", "-", "wide", "field", "study", "assessing", "honey", "bee", "colony", "development", ",", "brood", "development", ",", "and", "floral", "nectar", "as", "well", "as", "gut", "microbiomes", "under", "fungicide", "exposure", "and", "pollen", "restriction", "in", "2022", "\n\n", "Abstract", ":", "\n", "The", "data", "set", "contains", "the", "corresponding", "raw", "data", "from", "the", "publication", ":", "Wueppenhorst", "et", "a.", "(", "2024", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-startTime", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
59
en
OpenAgrar
Counter({'startTime': 1})
1
10.5073/20240715-163626-0
97814-0
97814.txt
[ "Honey", "bee", "colonies", "can", "buffer", "short", "-", "term", "stressor", "effects", "of", "pollen", "restriction", "and", "fungicide", "exposure", "on", "colony", "development", "and", "the", "microbiome", "(", "DOI", ":", "10.1016", "/", "j.ecoenv.2024.116723", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
30
en
OpenAgrar
Counter()
0
10.5073/20240715-163626-0
97814-1
97814.txt
[ "A", "total", "of", "128", "honey", "bee", "colonies", "were", "subjected", "to", "a", "Germany", "-", "wide", "field", "trial", ",", "during", "which", "they", "were", "exposed", "to", "combined", "stressors", ",", "namely", "fungicide", "exposure", "and", "pollen", "restriction", ",", "from", "April", "2022", "to", "April", "2023", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 9, 10, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-startTime", "I-startTime", "O", "B-endTime", "I-endTime", "O" ]
40
en
OpenAgrar
Counter({'startTime': 1, 'endTime': 1})
2
10.5073/20240715-163626-0
97814-2
97814.txt
[ "The", "parameters", "of", "colony", "development", "and", "brood", "development", "were", "recorded", "over", "the", "course", "of", "the", "bee", "season", ",", "while", "microbiome", "data", "was", "collected", "during", "the", "treatment", "phase", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
28
en
OpenAgrar
Counter()
0
10.5073/20240715-163626-0
97814-3
97814.txt
[ "Colony", "population", "estimates", "were", "conducted", "at", "three", "-", "week", "intervals", ",", "commencing", "with", "the", "blooming", "of", "the", "oilseed", "rape", "field", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 14, 14, 14, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-duration", "I-duration", "I-duration", "I-duration", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
21
en
OpenAgrar
Counter({'duration': 1})
1
10.5073/20240715-163626-0
97814-4
97814.txt
[ "Brood", "assessment", "was", "performed", "during", "the", "treatment", "phase", ",", "with", "the", "first", "brood", "cycle", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
15
en
OpenAgrar
Counter()
0
10.5073/20240715-163626-0
97814-5
97814.txt
[ "In", "-", "hive", "bees", "and", "forager", "bees", "were", "collected", "before", ",", "during", ",", "and", "after", "the", "treatment", "phase", ",", "and", "their", "gut", "microbiomes", "were", "analyzed", "for", "abundances", "of", "five", "core", "species", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
32
en
OpenAgrar
Counter()
0
10.5073/20240715-163626-0
97814-6
97814.txt
[ "Additionally", ",", "plant", "flowers", "of", "the", "oilseed", "rape", "were", "collected", "and", "analyzed", "for", "nectar", "-", "inhabiting", "yeast", "species", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 15, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cropSpecies", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
19
en
OpenAgrar
Counter({'cropSpecies': 1})
1
10.5073/20240715-163626-0
97814-7
97814.txt
[ "All", "parameters", "can", "be", "found", "in", "separate", "data", "tables", "accompanied", "by", "an", "explanatory", "metadata", "file", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
16
en
OpenAgrar
Counter()
0
10.5073/20240715-163626-0
97814-8
97814.txt
[ "Dataset", "comprises", "of", "five", "individual", "data", "tables", "a", ")", "Data", "of", "honey", "bee", "colony", "assessments", "from", "spring", "to", "autumn", "2022", "(", "Population_data.xlsx", ")", ",", "b", ")", "Data", "of", "honey", "bee", "overwintering", "success", "(", "Overwintering_Data.xlsx", ")", ",", "c", ")", "Data", "of", "honey", "bee", "brood", "assessment", "of", "the", "first", "brood", "cycle", "within", "treatment", "period", "(", "Brood_Data.xlsx", ")", ",", "d", ")", "qPCR", "data", "to", "determine", "the", "core", "microbiome", "bacterial", "abundances", "(", "Microbiome_Data.xlsx", ")", ",", "e", ")", "Data", "of", "nectar", "yeast", "abundances", "of", "rape", "seed", "flowers", "(", "Nectaryeast_Data.xlsx", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 9, 10, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-startTime", "O", "B-endTime", "I-endTime", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
86
en
OpenAgrar
Counter({'startTime': 1, 'endTime': 1})
2
10.5073/20240715-163626-0
97814-9
97814.txt
[ "Further", "information", "about", "the", "experimental", "setup", "can", "be", "found", "in", "the", "corresponding", "publication", "(", "doi", ":", "10.1016", "/", "j.ecoenv.2024.116723", ")", ".", "\n\n" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
22
en
OpenAgrar
Counter()
0
10.5073/20240715-163626-0
97814-10
ab919c54-d54c-4e04-84b0-fae2f7cac51b.txt
[ "Title", ":", "\n ", "BonaRes", "-", "SIGNAL", "biomass", "production", "starting", "in", "2016", "\n", "Abstract_text_1", ":", "\n ", "BonaRes", "-", "SIGNAL", "biomass", "production", "starting", "in", "2016", ".", "\n" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-startTime", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-startTime", "O", "O" ]
25
en
BonaRes
Counter({'startTime': 2})
2
https://doi.org/10.20387/bonares-qp1a-wdcc
ab919c54-d54c-4e04-84b0-fae2f7cac51b-0
ab919c54-d54c-4e04-84b0-fae2f7cac51b.txt
[ "Abstract_text_2", ":", "\n ", "This", "data", "set", "contains", "leaf", "litter", ",", "woody", "biomass", ",", "grain", ",", "shredded", "corn", ",", "straw", "and", "grass", "production", "on", "the", "sites", "of", "SIGNAL", "(", "Sustainable", "Intensification", "of", "Agriculture", "through", "Agroforestry", ")", "at", "Dornburg", "(", "Thuringia", ")", ",", "Forst", "(", "Brandenburg", ")", ",", "Wendhausen", "and", "Mariensee", "(", "both", "Lower", "Saxony", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 21, 0, 0, 11, 0, 11, 0, 0, 11, 0, 11, 0, 0, 21, 22, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-city", "O", "B-region", "O", "O", "B-city", "O", "B-city", "O", "O", "B-city", "O", "B-city", "O", "O", "B-region", "I-region", "O", "O" ]
55
en
BonaRes
Counter({'city': 5, 'region': 2})
7
https://doi.org/10.20387/bonares-qp1a-wdcc
ab919c54-d54c-4e04-84b0-fae2f7cac51b-1
ab919c54-d54c-4e04-84b0-fae2f7cac51b.txt
[ "Research", "domain", ":", "Ecology", "of", "Agricultural", "Landscapes", "Research", "question", ":", "Does", "alley", "-", "cropping", "agroforestry", "pose", "a", "more", "sustainable", "alternative", "to", "conventional", "monocultures", "?", "\n", "Keywords", ":", "\n ", "Soil", ",", "biomass", ",", "Renewable", "resources", ",", "organic", "matter", ",", "Wood", ",", "Forest", "products", ",", "Softwood", ",", "straw", ",", "grasses", ",", "Feed", "grasses", ",", "opendata", ",", "Boden", "\n" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
56
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.20387/bonares-qp1a-wdcc
ab919c54-d54c-4e04-84b0-fae2f7cac51b-2
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "Title", ":", "\n ", "Determination", "of", "spider", "mite", "abundance", "in", "soil", "of", "field", "-", "grown", "cucumbers", "and", "in", "plants", "under", "predatory", "mite", "pressure", "in", "invasive", "infestations", "using", "HRM", "real", "-", "time", "PCR", "assay", "(", "Part", "2", "of", "data", "collection", ",", "table", "KERSTEN_ET_AL_DATA_FIG5", ")", "\n", "Abstract_text_1", ":", "\n ", "Determination", "of", "spider", "mite", "abundance", "in", "soil", "of", "field", "-", "grown", "cucumbers", "and", "in", "plants", "under", "predatory", "mite", "pressure", "in", "invasive", "infestations", "using", "HRM", "real", "-", "time", "PCR", "assay", "(", "Part", "2", "of", "data", "collection", ",", "table", "KERSTEN_ET_AL_DATA_FIG5", ")", ".", "\n" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 15, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 15, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cropSpecies", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cropSpecies", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
87
en
BonaRes
Counter({'cropSpecies': 2})
2
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-0
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "Abstract_text_2", ":", "\n ", "Between", "2017", "and", "2019" ]
[ 0, 0, 0, 0, 7, 0, 9 ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-startTime", "O", "B-endTime" ]
7
en
BonaRes
Counter({'startTime': 1, 'endTime': 1})
2
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-1
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "we", "studied", "the", "abundance", "of", "spider", "mites", "in", "the", "soil", "to", "estimate", "the", "potential", "infestation", "pressure", "of", "soil", "colonizing", "spider", "mites", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
22
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-2
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "The", "spider", "mites", "were", "heterogeneously", "distributed", "in", "small", "concentrations", "in", "the", "soil", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
13
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-3
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "Soil", "colonizing", "spider", "mites", "did", "not", "affect", "spider", "mite", "abundance", "on", "plants", "and", "reversed", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
15
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-4
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "We", "observed", "that", "spider", "mite", "migration", "occurred", "primarily", "from", "the", "edge", "of", "the", "field", "adjacent", "to", "the", "weed", "strip", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
20
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-5
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "In", "2020", "and", "2021", ",", "we", "investigated", "the", "efficacy", "of", "the", "predatory", "mite", "Neoseiulus", "californicus", "(", "McGregor", ")", "for", "suppressing", "spider", "mite", "hotspots", "in", "the", "cropland", "." ]
[ 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "B-startTime", "O", "B-startTime", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
27
en
BonaRes
Counter({'startTime': 2})
2
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-6
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "We", "compared", "untreated", "spider", "mite", "hotspots", "with", "N.", "californicus", "treated", "hotspots", "and", "showed", "that", "a", "single", "release", "of", "predatory", "mites", "could", "result", "in", "a", "high", "level", "of", "control", "when", "spider", "mite", "infestation", "density", "was", "initially", "high", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
37
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-7
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "With", "this", "study", ",", "soil", "can", "be", "ruled", "out", "as", "a", "habitat", "for", "spider", "mites", ",", "and", "attention", "to", "spider", "mite", "pest", "control", "can", "be", "directed", "to", "plant", "infestations", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
30
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-8
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "The", "highly", "sensitive", "HRM", "real", "-", "time", "PCR", "assay", "was", "used", "for", "the", "quantification", "of", "the", "spider", "mites", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
19
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-9
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "Tetranychus", "urticae", "served", "as", "reference", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
6
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "Research", "domain", ":", "Soil", "Sciences", "Research", "question", ":", "Does", "the", "soil", "serve", "as", "a", "shelter", "for", "spider", "mites", "and", "must", "the", "soil", "be", "included", "in", "control", "strategies", "?" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
28
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-11
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "Does", "invasive", "infestation", "by", "spider", "mites", "occur", "on", "crops", "starting", "from", "the", "soil", "?" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
14
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-12
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "Can", "the", "targeted", "use", "of", "predatory", "mites", "contain", "spider", "mite", "hotspots", "?" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
12
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-13
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "table", "KERSTEN_ET_AL_DATA_FIG5", ":", "Spider", "mite", "abundance", "in", "the", "phyllosphere", "and", "soil", "of", "an", "open", "field", "cucumber", "cultivation", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
18
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-14
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "Plot", "dimensions", "were", "500", "m", "long", "and", "30", "m", "wide", "included", "19", "plants", "rows", "and", "6", "transects", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
18
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-15
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "Three", "to", "five", "leaves", "and", "two", "soil", "samples", "were", "collected", "at", "one", "sampling", "point", "and", "merged", "together", "for", "analysis", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
20
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-16
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "Quantification", "of", "spider", "mites", "in", "the", "samples", "was", "conducted", "by", "HRM", "real", "-", "time", "PCR", "(", "spider", "mite", "number/", "100", "g", "sample", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
24
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-17
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "Related", "datasets", "are", "listed", "in", "the", "metadata", "element", "'", "Related", "Identifier", "'", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
13
en
BonaRes
Counter()
0
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-18
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00.txt
[ "Dataset", "version", "1.0", "\n", "Keywords", ":", "\n ", "Soil", ",", "Tetranychidae", ",", "soil", "biology", ",", "pest", "control", ",", "infestation", ",", "plant", "protection", ",", "Cucumis", "sativus", ",", "opendata", ",", "Rote", "Spinne", ",", "crop", "protection", ",", "Boden", "\n" ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 15, 16, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cropSpecies", "I-cropSpecies", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
35
en
BonaRes
Counter({'cropSpecies': 1})
1
https://doi.org/10.4228/zalf-6ecw-hs10
1a52ac80-d78d-4a2a-9e5d-8699ce3b0f00-19
99969.txt
[ "Title", ":", "\n", "Dataset", ":", "Abundance", "and", "composition", "of", "microbiomes", "in", "agricultural", "biogas", "plants", "in", "Lower", "Saxony", ",", "Germany", ",", "with", "variation", "in", "organic", "substrates", ",", "process", "parameters", "and", "nutrients", "\n\n", "Abstract", ":", "\n", "Die", "hier", "hinterlegten", "Daten", "beziehen", "sich", "auf", "die", "Publikation", "von", "Forschungsergebnissen", "aus", "dem", "Verbundvorhaben", "„", "Abundanz", "und", "Vielfalt", "von", "Clostridium", "in", "landwirtschaftlichen", "Biogasanlagen", "unter", "besonderer", "Berücksichtigung", "von", "Clostridium", "botulinum", "“", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 21, 22, 0, 23, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-region", "I-region", "O", "B-country", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
65
de
OpenAgrar
Counter({'region': 1, 'country': 1})
2
10.3220/DATA20240919153413-0
99969-0
99969.txt
[ "In", "diesem", "Zusammenhang", "wurden", "Proben", "aus", "niedersächsischen", "landwirtschaftlichen", "Biogasanlagen", "in", "Hinblick", "auf", "die", "Zusammensetzung", "und", "Abundanz", "der", "mikrobiellen", "Lebensgemeinschaften", "(", "Bakterien", "und", "Archaeen", ")", "untersucht", "und", "dabei", "ein", "möglicher", "Zusammenhang", "mit", "den", "eingesetzten", "organischen", "Substraten", ",", "den", "Prozessparametern", "und", "den", "Nährstoffen", "untersucht", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 21, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
43
de
OpenAgrar
Counter({'region': 1})
1
10.3220/DATA20240919153413-0
99969-1
99969.txt
[ "Die", "Abundanz", "von", "Bakterien", "und", "Archaeen", "wurde", "mit", "Hilfe", "der", "quantitativen", "PCR", "von", "16S", "rRNA", "Genen", "kultivierungsunabhängig", "aus", "DNA", "der", "vergärenden", "Substrate", "bestimmt", "und", "die", "Vielfalt", "über", "DNA", "-", "Sequenzierungen", "der", "16S", "rRNA", "Gene", "mit", "Hilfe", "der", "Illumina", "MiSeq", "Technologie", "ermittelt", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
42
de
OpenAgrar
Counter()
0
10.3220/DATA20240919153413-0
99969-2
99969.txt
[ "Insgesamt", "reicht", "der", "vorhandene", "Datensatz", "von", "neun", "Biogasanlagen", "nicht", "aus", ",", "um", "alleinstehend", "einen", "belastbaren", "Zusammenhang", "zwischen", "den", "mikrobiologischen", "und", "den", "abiotischen", "Parametern", "abzuleiten", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
25
de
OpenAgrar
Counter()
0
10.3220/DATA20240919153413-0
99969-3
99969.txt
[ "Hinweise", "auf", "ein", "mögliches", "Vorkommen", "von", "C.", "botulinum", "ergaben", "sich", "nicht", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
12
de
OpenAgrar
Counter()
0
10.3220/DATA20240919153413-0
99969-4
End of preview. Expand in Data Studio

Dataset Card for A Manually Annotated Agricultural Dataset for AI-Based NER and FAIR Metadata Enrichment

Supported by FAIRagro, the pilot use case “Increasing FAIRness of FAIRagro data through AI-supported metadata enrichment” addresses this gap by creating a manually annotated text corpus designed to support Named Entity Recognition (NER) models in agricultural research. NER models can automate metadata extraction from unstructured text, such as dataset abstracts, thereby enabling metadata enrichment.

Dataset Details

Dataset Description

This dataset contains Named Entity Recognition (NER) annotations derived from curated CAS XMI files exported from INCEpTION.
The corpus is provided in three complementary formats, each optimized for different model architectures and evaluation scenarios:

  1. Document-level tokenized (file-based) CSV
  2. Sentence-level tokenized CSV

Annotation Entities, Their Attributes, and Definitions

Entity Attribute Definition
Crop Crop species The name of a taxonomic rank of a plant. This can either be a scientific name or a common name. Each mention of such a name is a distinct annotation. Consult taxonomies such as AGROVOC (https://agrovoc.fao.org/browse/agrovoc/en/) for reference.
Crop Crop variety The name of a specific variety of a plant.
Soil Soil texture Soil texture measures the proportion of sand, silt, and clay-sized particles in a soil sample. Annotate a soil texture if it is part of a soil texture classification, such as the USDA Soil Texture Classification (12 soil textures) or the textures from the Bodenkundliche Kartieranleitung.
Soil Soil reference group A categorization of soil groups following the WRB Reference Soil Group (RSG) definitions (https://inspire.ec.europa.eu/codelist/WRBReferenceSoilGroupValue).
Soil Soil depth Soil depth measures the depth from which a soil sample was taken.
Soil Bulk density The dry weight of soil divided by its volume.
Soil pH value Hydrogen ion concentration in a soil sample.
Soil Organic carbon Measurable components of soil organic matter in a soil sample.
Soil Available nitrogen Nitrogen that is present in a soil sample and available to plants. Only annotate explicit mentions of available nitrogen and ensure the reference is to soil nitrogen, not fertilizer nitrogen.
Location Location name The name of a location related to a dataset. These may include continents (e.g., “Europe”), countries (e.g., “Germany”), federal states (e.g., “Lower Saxony”), regions (e.g., “Kraichgau”), cities, villages, towns (e.g., “Quedlinburg”), or municipalities (e.g., “Grossbeeren”).
Location Latitude The north–south angular position of a location. Annotate the coordinate(s).
Location Longitude The west–east angular position of a location. Annotate the coordinate(s).
Time statement Start time A point in time when an event related to a dataset started (e.g., data collection). This may be a date, a season, or a combination. Annotate all relevant points if multiple events exist. If only one time point is known, use this property.
Time statement End time A point in time when an event related to a dataset ended (e.g., data collection). This may be a date, a season, or a combination. Annotate all relevant points if multiple events exist.
Time statement Duration A range between two time points. Use this property if start and end points are unknown.

Dataset Versions

1️⃣ Document-Level Tokenized Format (File-Based)

Each row in this CSV corresponds to a complete document, tokenized using spaCy.

Columns
Column Description
file_name Unique filename ID of the document
Tokens List of tokens (words)
Labels BIO labels aligned 1:1 with tokens
ner_tags Integer mapping of labels for training
number_of_tokens Total token count
Language "en" or "de"
source Origin repository (BonaRes or OpenAgrar)
Label_counts Counter object with annotation frequency
number_of_annotations Sum of all annotated entity spans
DOI Document DOI (when available)

Intended Use

  • Document-level transformer models (Longformer, BigBird, etc.)
  • Corpus statistics and label distribution analysis
  • Document classification + NER pipelines

2️⃣ Sentence-Level Tokenized Format

Each row corresponds to a single sentence, preserving alignment with the original document.

Sentence Identifier Format 

fileID-sentenceIndex
Example:
73465-03

Columns

Same as file-level format, with:

Column Description
sentence_id Sentence identifier combining file name and sentence index

Intended Use

  • Classical BERT-style NER (max length ≈512 tokens)
  • Models with fixed-length input windows
  • Fine-grained sentence-level training and evaluation

Code Repository

All scripts used to preprocess the INCEpTION XMI files, generate the tokenized datasets, convert annotations into BIO format, create JSON span annotations, and build the HuggingFace-ready dataset version are openly available in the following GitHub repository:

🔗 Dataset Processing Code Repository:
https://github.com/fairagro/pilot-uc-textmining-metadata The current version is v1.0.0

The repository includes:

  • Fetching the metadata from the research data infrastructures
  • CAS → BIO conversion scripts
  • Sentence and document tokenization routines
  • Gazetteer-based location normalization
  • DOI mapping utilities
  • Span annotation builder (HuggingFace-like JSON format)
  • Dataset export pipeline (CSV, JSON, HuggingFace)
  • Example configuration files
  • A full reproducible workflow for regenerating the dataset

Authors and Affiliations

Name ORCID Affiliation
Abanoub Abdelmalak 0009-0001-0892-3614 ZB MED – Information Centre for Life Sciences; University of Bonn
Gabriel Schneider 0000-0001-6573-3115 ZB MED – Information Centre for Life Sciences; University of Bonn
Heike Riegler 0000-0002-1302-4533 Julius Kühn-Institut
Kristin Meier 0009-0003-1966-9679 Leibniz Centre for Agricultural Landscape Research (ZALF)
Xenia Specka 0000-0002-1890-0192 Leibniz Centre for Agricultural Landscape Research (ZALF)
Nikolai Svoboda 0000-0003-3860-4400 Leibniz Centre for Agricultural Landscape Research (ZALF)
Murtuza Husain 0009-0004-1496-5644 ZB MED – Information Centre for Life Sciences; University of Bonn
Juliane Fluck 0000-0003-1379-7023 ZB MED – Information Centre for Life Sciences; University of Bonn

Licensing

The FAIRagro Metadata Enrichment NER Dataset is released under the:

Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0) License

License URL:

https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Cite as: 

@dataset{abdelmalak_fairagro_ner_2025,
  author       = {Abdelmalak, Abanoub and Schneider, Gabriel and Riegler, Heike and Meier, Kristin and Specka, Xenia and Svoboda, Nikolai and Husain, Murtuza and Fluck, Juliane},
  title        = {{FAIRagro NER Dataset: Increasing FAIRness of FAIRagro Data Through AI-Supported Metadata Enrichment}},
  year         = {2025},
  publisher    = {Fachrepositorium Lebenswissenschaften (FRL)},
  doi          = {10.4126/FRL01-6526458},
  url          = {https://doi.org/10.4126/FRL01-6526458},
  note         = {Version 1.0}
}
Downloads last month
19
Size of downloaded dataset files:
375 kB
Size of the auto-converted Parquet files:
375 kB
Number of rows:
3,041